有相关方提出变更，就按照整体变更流程的步骤处理。A属于流程的第二步：评估。B不能由项目经理直接拒绝变更，要拒绝也要根据流程提交批复，由批复人给与审批结果；同理C选项也不能直接就接收变更。D选项属于搁置变更，当有相关方提出变更请求后，需要及时处理，而不能搁置到以后处理。

在项目启动大会上，首席执行官（CEO）提出的变更将会影响项目范围，项目经理应该如何响应，这是一个涉及项目管理和沟通技巧的问题。让我们逐一分析每个选项：

A: **Advise the CEO that the project team will investigate the proposed changes.**
这个选项是合理的，因为它表明项目经理愿意认真对待CEO的建议，同时也表明需要进行进一步的分析和评估。这种做法符合项目管理的最佳实践，因为在接受任何变更之前，了解其对项目范围、时间、成本和质量的影响是非常重要的。

B: **Inform the CEO that the scope was already finalized and cannot be changed.**
这个选项过于武断。在项目管理中，范围变更是常见的，尤其是在高层管理人员提出变更时。项目范围虽然在启动阶段已确定，但并不是不可变的。合理的变更管理过程允许对项目范围进行调整，以满足新的业务需求或战略目标。

C: **Accept the changes as requested by the CEO.**
直接接受变更是不建议的做法。即使变更请求来自CEO，项目经理也应进行适当的评估和变更管理流程，以确保变更是可行的，并不会对项目的其他方面产生负面影响。

D: **Consider the CEO's changes during the project's implementation phase.**
推迟对变更的考虑可能会导致项目后期出现更大的问题。变更请求应尽早评估，以便在项目生命周期的早期阶段做出明智的决策。

综上所述，最合适的答案是 **A: Advise the CEO that the project team will investigate the proposed changes.** 这种回应方式既尊重了CEO的请求，又确保对变更的影响进行适当的评估和分析，这符合项目管理的规范和最佳实践。