变更请求已经获得批准，1记录 2评估 3提交 4更新 5通知。接下来应该是更新。

在处理变更请求时，项目经理需要考虑变更对项目的各个方面的影响。在这个问题中，变更请求影响到了项目成本和项目进度。以下是对每个选项的分析：

A: 变更基准。
变更基准是指项目的范围基准、进度基准和成本基准。在变更请求影响到项目成本和进度的情况下，项目经理需要更新相应的基准以反映变更后的计划。因此，变更基准是一个合理的步骤。

B: 变更风险登记册。
虽然变更可能会引入新的风险或改变现有风险的性质，但题目中并未提到变更对风险的直接影响。因此，虽然更新风险登记册可能是后续的步骤，但它不是直接的首要任务。

C: 变更工作分解结构。
工作分解结构（WBS）主要用于定义项目的范围。如果变更对项目的范围有影响，那么可能需要更新WBS。然而，题目中只提到了成本和进度的影响，因此直接变更WBS并不是首要任务。

D: 变更资源管理计划。
资源管理计划涉及到资源的分配和使用。如果变更影响到资源的使用，那么可能需要更新资源管理计划。题目中没有具体提到资源的变化，因此这不是最直接的行动。

综上所述，最直接和必要的行动是更新项目的基准，以反映变更对成本和进度的影响。因此，正确答案是：

A: 变更基准。