定位：资源知识领域，获取资源子过程，工具：谈判。注意P333的“例如”

对于这个问题，项目经理在确认矩阵组织中资源可用性时发现某个关键资源已调往一个内部项目，首先需要采取的行动应该是与职能经理协商将资源重新调回项目，即选项D。

分析如下：

1. **矩阵组织结构**：在矩阵组织中，资源通常由职能经理管理。项目经理需要与职能经理沟通和协商资源的分配和调度。因此，直接与职能经理协商是最直接和合适的行动。

2. **沟通与协商**：项目经理的角色之一是有效地沟通和协商，以确保项目资源的可用性。与职能经理协商可以帮助项目经理了解资源调动的原因，并探讨可能的解决方案。

3. **其他选项分析**：
- **A: 与项目赞助人协商推迟项目**：推迟项目通常是最后的选择，因为它可能影响项目的整体进度和成本。首先应该尝试解决资源问题，而不是立即选择推迟。
- **B: 要求项目管理办公室将资源重新调回项目**：项目管理办公室通常不直接管理具体资源的分配，资源调动的决策权更多在职能经理手中。
- **C: 更新风险登记册**：虽然更新风险登记册是必要的，但它是记录和计划的步骤，而不是立即解决资源问题的直接行动。

因此，最佳的初步行动是与职能经理协商，尝试解决资源调动的问题。