冲突管理的顺序，首先由团队成员自行解决，然后项目经理提供协助，最用采用正式的流程。

正确答案是：C:与两位成员召开协调会议解决问题。

专业分析：

A: 让团队成员的职能经理解决问题
- 这种方法可能会将问题推给其他人，而不是直接解决冲突。职能经理可能不完全了解项目的具体情况，可能无法有效解决团队内部的冲突。

B: 允许两位团队成员自己寻找差异
- 虽然鼓励团队成员自己解决问题是好的，但在冲突已经影响到整个团队士气的情况下，项目经理需要积极介入，以确保冲突得到有效解决。

C: 与两位成员召开协调会议解决问题
- 这种方法是最有效的，因为项目经理可以直接介入，了解冲突的根源，并引导双方通过沟通和协商来解决问题。这样可以确保冲突不会进一步升级，并能迅速恢复团队的士气。

D: 分别与两位成员澄清项目目标与期望
- 虽然澄清项目目标和期望是重要的，但如果不解决两人之间的冲突，这种方法可能无法直接提高团队士气。项目经理需要确保双方在同一平台上进行沟通，解决根本问题。

因此，选项C是最合适的解决方案，因为它直接针对问题的根源，并有助于恢复和提高团队的整体士气。