发生了“有关键团队成员离职”的风险，虽然当时项目还符合进度计划，但仍应查阅风险登记册，实施记录的该风险的应对措施。

在这种情况下，项目经理应该选择A: 实施风险应对计划。

分析如下：

1. **实施风险应对计划**：在项目管理中，关键人员的离职通常被视为一个风险。项目经理应该在项目的早期阶段就识别出这种风险，并制定相应的风险应对计划。当风险实际发生时，项目经理需要立即实施这个计划，以尽量减少对项目的影响，并保证项目继续按计划进行。

2. **通知项目发起人**（选项B）和**通知客户项目将延迟**（选项C）：虽然通知相关方是项目经理的职责之一，但在这个阶段，项目经理首先需要采取措施来解决问题，而不是直接通知项目发起人或客户项目将延迟。只有在评估了影响并实施了风险应对措施后，如果项目仍然无法按计划进行，才需要与项目发起人和客户沟通。

3. **更新项目管理计划**（选项D）：虽然更新项目管理计划是必要的，但这通常是在实施风险应对计划之后进行的。当关键人员离职时，项目经理首先需要执行风险应对措施，然后根据新情况更新项目计划。

因此，最合适的初步行动是实施风险应对计划，以确保项目的连续性和进度。