关键资源要离开，属于一个提出的变更请求，针对变更请求需要遵循整体变更流程。选项C是变更流程的第二步评估，在所有选项中步骤最优先；选项A不合适是因为留下并不一定是最好的选择，针对变更请求还是要记录评估提交批复确定是否留还是走；选项B非资金或重大战略问题不要麻烦发起人，何况是否允许离开要看变更请求批复情况；选项D拒绝变更请求也需要流程确定。

在这种情况下，项目经理需要在平衡项目需求和团队成员个人需求之间做出明智的决策。以下是对每个选项的分析：

A: 使用人际关系技能劝说该员工留下。
- 这种方法可以暂时解决问题，但如果员工有正当的原因需要离开，这种做法可能会影响员工的士气和对项目的投入。

B: 通知项目发起人,并允许该工程自愿离开。
- 通知项目发起人是重要的沟通步骤，但立即允许员工离开可能会对项目产生不利影响，尤其是在关键阶段。

C: 评估对进度计划的影响。
- 这是一个合理的第一步。通过评估员工离开的影响，项目经理可以更好地理解情况的严重性，并制定相应的应对计划。

D: 要求该工程资源继续工作。
- 这种方法可能会在短期内保持项目进度，但可能会导致员工不满或影响长期的团队合作。

综合考虑，正确的答案是C: 评估对进度计划的影响。项目经理首先需要了解员工离开的影响程度，然后才能决定下一步的行动。这可能包括调整项目计划、寻找临时替代人选或者与员工协商一个折中的方案。在评估的基础上，项目经理可以做出更为合理和信息充分的决策。