题干描述的是变更请求完成了第3步的“提交CCB批复”，选项D描述的是接下来的第4步“更新”，至少要更新变更日志，还可能更新项目管理计划和文件。然后是第5步“通知”。

正确答案是：D: 更新变更日志,并通知项目相关方变更已被拒绝。

专业分析：

在项目管理中，变更控制是一个关键的过程。变更请求被拒绝后，项目经理有责任确保所有相关方都清楚这一决定，并且项目文档也要反映这一变更请求的状态。

- A选项“不采取行动”是不合适的，因为即使变更被拒绝，项目经理仍需记录这一决定并通知相关方，以确保透明度和信息的一致性。

- B选项“更新经验教训”是一个好的实践，但它并不是项目经理在变更被拒绝后立即需要做的首要任务。经验教训的更新通常是在项目结束时或在项目的特定阶段进行回顾时进行。

- C选项“通知运营团队变更不能够得到满足,但可以在未来考虑”虽然是沟通的一部分，但没有提到更新变更日志，这是一个重要的步骤。

- D选项“更新变更日志,并通知项目相关方变更已被拒绝”是最全面和准确的做法。更新变更日志确保所有变更请求的状态都被记录下来，并且通知相关方有助于维持透明的沟通渠道。

因此，D选项是最符合项目管理最佳实践的选择。