排除法，只有B能说得过去。

在这个情境中，项目经理应该首先关注变更管理流程的遵循情况。虽然变更已经被实施并且得到了团队的一致同意，但在敏捷项目中，变更管理仍然是一个需要正式化的过程，以确保所有变更都被正确记录和追踪。

正确答案是：C:与项目团队开会，讨论变更控制过程。

专业分析：

1. **变更管理的重要性**：即使在敏捷环境中，变更管理仍然是确保项目范围、时间和成本得到有效控制的关键。一个正式的变更管理流程有助于避免范围蔓延和未授权的变更。

2. **敏捷中的灵活性与流程**：敏捷方法强调快速响应变化，但这并不意味着可以忽略变更管理流程。相反，敏捷团队需要在灵活性和流程控制之间找到平衡。

3. **团队协作与沟通**：与团队开会讨论变更控制过程，可以帮助团队理解变更管理的重要性，并确保未来的变更都经过适当的审查和批准流程。

4. **防止未来问题**：通过讨论和改进变更控制过程，项目经理可以防止类似问题在未来再次发生，提高项目管理的成熟度。

其他选项分析：
- A: 将该不一致性问题通知相关方：虽然通知相关方是必要的，但更重要的是解决根本问题，即变更控制流程的遵循。
- B: 将已完成的变更更新到工作范围中：这是必要的操作，但不解决流程不遵循的问题。
- D: 向变更控制委员会（CCB）登记这项变更并请求批准：在敏捷项目中，通常没有传统的CCB，且变更已经实施，事后请求批准意义不大。