验收不合格，步骤：1.记录原因，2提交变更请求。确认范围的工具是检查，并没有偏差分析这个工具，而且题干中已经明确提出不符合约定。

在处理组织变更管理项目时，面对来自不同部门的相关方提出的需求，项目经理需要仔细评估这些需求，特别是当一些需求看起来不切实际或超出项目范围时。选项分析如下：

A: 记录需要澄清和分析的所有需求
这是一个合理的步骤。记录所有需求，并对不切实际或超出范围的需求进行进一步的澄清和分析，可以帮助项目经理更好地理解这些需求的背景和目的。这也是项目经理与相关方沟通的良好基础。

B: 从需求文件中排除低层级需求
直接排除低层级需求可能会导致遗漏一些潜在的重要信息，或者引起相关方的不满。此步骤可能过于武断，不建议直接采用。

C: 将所有需求包含进工作说明书（SOW）中
将所有需求不加区分地纳入工作说明书可能导致项目范围失控，并可能对项目的时间、成本和资源产生不利影响。因此，这并不是一个明智的做法。

D: 更新相关方登记册以包含这些需求
相关方登记册主要是用于记录和管理相关方信息，而不是记录需求的工具。将需求列入相关方登记册并不合适。

基于以上分析，正确的答案是A: 记录需要澄清和分析的所有需求。这样做可以确保项目经理在对需求进行评估和优先级排序时，能够有一个完整的信息基础，并且能够与相关方进行有效的沟通和协商，以达成共识。