题干关键词：客户发现的故障。联想到质量成本中的外部失败成本。对于客户发现的故障，是一定要解决的，而需要先估算解决故障需要花费的质量成本，继而评估对整个项目的其他方面的影响。A选项成本效益分析一般用于启动论证或规划使用，不用于解决故障。C选项不是工具和技术，D选项和题干描述没多大关系。

在这个场景中，项目经理需要评估系统故障对项目的影响。这通常涉及分析问题对项目的时间表、预算、质量和其他关键因素的影响。以下是对选项的分析：

A: 成本效益分析（Cost-benefit analysis）主要用于评估某项决策或行动的经济价值，通过比较其成本和预期收益来决定是否值得实施。这种分析不直接用于评估系统故障对项目的影响。

B: 质量成本（Cost of quality, COQ）涉及在项目中为了确保质量所发生的成本，包括预防成本、评估成本、内部失败成本和外部失败成本。虽然COQ可以帮助理解质量问题的成本，但它不直接用于评估特定故障对整个项目的影响。

C: 质量管理方法（Quality management methodologies）是指用于确保项目产品或服务质量的各种方法和工具，如六西格玛、全面质量管理（TQM）等。这些方法可能涉及评估和改进质量过程，但它们通常不是专门用于评估系统故障对项目整体影响的工具。

D: 标杆对照（Benchmarking）是一种通过比较项目或组织的性能与行业最佳实践或其他项目的性能来评估和改进的方法。虽然标杆对照可以帮助识别改进机会，但它通常不用于直接评估特定故障对项目的影响。

在这个情况下，项目经理需要的是评估系统故障对项目的整体影响，而不是单纯的质量管理或成本分析。因此，这个场景最符合C: 质量管理方法（Quality management methodologies），因为它涉及使用各种工具和方法来评估和改进项目质量，包括评估故障对项目的影响。