在MLlib提供的分布式矩阵中，只有`CoordinateMatrix`是同时具有行索引和列索引的矩阵。

- **A: RowMatrix** 是一种行矩阵，它的每一行是一个向量，但它不提供显式的行索引和列索引。它主要用于在行方向上进行分布式计算。

- **B: IndexedRowMatrix** 是一种带有行索引的矩阵。每一行都有一个显式的索引，但列没有显式的索引。它适用于需要对行进行标识的情况。

- **C: Matrix** 是一个本地矩阵，不是分布式矩阵。它通常用于小规模数据的本地计算，不能处理大规模分布式数据。

- **D: CoordinateMatrix** 是一种稀疏矩阵格式，它由一组坐标条目（行索引、列索引、值）组成。这种矩阵格式显式地存储了每个非零元素的行索引和列索引，因此适合于需要处理稀疏数据的场景。

因此，正确答案是 **D: CoordinateMatrix**。它在MLlib中用于需要处理稀疏矩阵并且需要显式行列索引的场景。