正确答案是 D: Chubby。

分析：
- Zookeeper 是一个分布式协调服务，主要用于分布式系统中的配置管理、命名服务、分布式同步和组服务。
- A: Protobuf 是 Google 开发的一种与语言无关、平台无关的可扩展机制，用于序列化结构化数据（例如，序列化和反序列化数据），与 Zookeeper 的用途和功能不相似。
- B: Java 是一种编程语言，与 Zookeeper 不是同一类型的技术或工具。
- C: Kafka 是一个分布式流处理平台，主要用于构建实时数据管道和流应用，与 Zookeeper 的功能和用途也不同。尽管 Kafka 在内部使用 Zookeeper 来管理集群状态，但它本身不是一个协调服务。
- D: Chubby 是 Google 开发的一个锁服务，用于大规模分布式系统中的协调任务。Chubby 和 Zookeeper 在功能上非常相似，都是用于分布式系统协调、管理配置、命名等任务的服务。因此，Chubby 与 Zookeeper 类似。

因此，正确答案是 D: Chubby。