在这个问题中，我们有两个3x3的二维数组`x`和`y`，目标是将这两个数组中的所有一维数组（即每一行）的元素合并到新的二维数组中对应的一维数组中。我们需要选择合适的`np.concatenate`方法来实现这一点。

选项分析：
- A: `np.concatenate([x, y], axis=2)`：对于二维数组，`axis=2`是不合法的，因为二维数组只有两个维度（轴），分别是`axis=0`（行）和`axis=1`（列）。
- B: `np.concatenate([x, y], axis=1)`：这个选项表示在列的方向上进行合并。对于每一行，`x`和`y`对应行的元素会被合并在一起，形成一个新的行。因此，这个选项是正确的。
- C: `np.concatenate([x, y], axis=0)`：这个选项表示在行的方向上进行合并，这会将`y`的行附加到`x`的行之后，而不是合并每一行的元素。
- D: `np.concatenate([x, y], axis=3)`：类似于选项A，对于二维数组，`axis=3`是不合法的。

因此，正确的答案是B: `np.concatenate([x, y], axis=1)`，它会将`x`和`y`的每一行的元素合并在一起，形成新的二维数组。