正确答案是：D: 列表中的元素不能重复。

### 分析：

- **A: 列表是有序的**
- 这句话是正确的。列表是Python中的一种数据结构，其元素是按照插入顺序排列的，可以通过索引访问特定元素。

- **B: 列表由方括号[]来表示**
- 这句话是正确的。在Python中，列表是用方括号`[]`定义的，元素之间用逗号分隔。

- **C: 列表中可以包含任何数据类型**
- 这句话是正确的。列表可以包含各种数据类型，例如整数、字符串、浮点数，甚至其他列表。

- **D: 列表中的元素不能重复**
- 这句话是不正确的。列表允许包含重复的元素。列表中的每个元素都有自己的索引位置，即使它们的值相同。

### 示例

```python
# 创建一个包含重复元素的列表
example_list = [1, 2, 2, 3, "apple", "apple"]

# 输出列表
print(example_list)
# 输出结果: [1, 2, 2, 3, 'apple', 'apple']
```

从上面的示例可以看出，Python 列表允许重复元素，且每个元素的位置或索引是独立的。