对于函数和方法之间的区别以及它们的使用，以下是对选项的分析：

- **A: 函数是作用于方法的，方法是作用于对象的**
- **分析**：此说法是错误的。函数和方法是两种不同的概念。函数是独立的代码块，可以在不依赖对象的情况下调用。而方法是属于对象或类的函数，通常需要通过对象实例来调用。

- **B: 一个功能如果可以使用方法来调用，一般就不会内置相同功能的函数**
- **分析**：此说法不完全正确。虽然在某些情况下，功能可能仅以方法的形式提供，但并不排除有相似功能的全局函数存在的可能性。例如，Python中有些内置函数可以直接操作，也有对应的方法属于对象（如字符串操作的函数和方法）。因此，是否同时存在取决于语言设计和具体功能需求。

- **C: 函数和方法都可以使用object.的方法运行**
- **分析**：此说法是错误的。方法通常通过对象调用（例如，`object.method()`），然而函数不需要对象，可以直接被调用（例如，`function()`）。

- **D: 方法的帮助文档无法通过?来进行调用**
- **分析**：此说法是错误的。以Python为例，在交互式解释器（如IPython或Jupyter Notebook）中，函数和方法的帮助文档可以通过在名称后添加问号（`?`）来调用（例如，`object.method?`）。这提供了函数或方法的文档字符串。

### 正确答案：
**没有一个选项是完全正确的。** 这里存在一些常见的误解和对编程语言的不同用法的混淆，需要根据具体语言和环境来看待函数和方法的概念。