正确答案是：D: 两个列表合并后，元素的索引依然是合并前的列表中的索引。

### 专业分析

在编程中，尤其是 Python 语言中，列表（List）是一种常用的数据结构。我们可以通过不同的操作来处理列表。以下是对各个选项的分析：

- **A: 列表的运算分为列表的重复和列表的合并两种**
- **分析**：这是一种基本的列表运算说法。列表可以通过乘法运算符`*`进行重复，以生成包含相同元素多次的列表；通过加法运算符`+`进行合并，以生成连接两个列表的新列表。因此，这种说法是正确的。

- **B: 两个列表合并后会保留重复值**
- **分析**：在列表合并操作中，重复的元素会保留。例如，合并 `[1, 2]` 和 `[2, 3]` 会得到 `[1, 2, 2, 3]`。这说明合并后的列表确实保留了重复值。因此，这种说法是正确的。

- **C: 列表重复相当于先复制后拼接**
- **分析**：列表重复是通过乘法运算符实现的，比如 `[1, 2] * 2` 会得到 `[1, 2, 1, 2]`，这相当于将原列表复制并拼接。所以这种说法是正确的。

- **D: 两个列表合并后，元素的索引依然是合并前的列表中的索引**
- **分析**：这是不正确的。当两个列表合并时，得到的新列表是一个全新的列表，其索引是从0开始的连续整数。合并后的元素索引与合并前的索引没有直接关系。例如，合并 `[1, 2]` 和 `[3, 4]` 会得到 `[1, 2, 3, 4]`，新列表的索引为 `0` 到 `3`。因此，这种说法是错误的。

在进行列表运算时，必须理解其特性和行为，以便在编程中正确使用这些操作。