正确答案是：C: 我的第一语言是Python, 我的第二语言是Java

### 分析：
在给定的程序中，使用了 Python 的字符串格式化方法 `str.format()`。这个方法可以将指定的值插入到字符串中的花括号`{}`标记的位置。

```python
s1 = "Java"
s2 = "Python"
print('我的第一语言是{}, 我的第二语言是{}'.format(s2, s1))
```

- `format(s2, s1)` 的意思是将 `s2` 和 `s1` 的值按顺序填充到前面的字符串中。
- 这里 `s2` 是 "Python" 和 `s1` 是 "Java"。
- 因此，第一个 `{}` 会被 `s2` 的值 "Python" 替换，第二个 `{}` 会被 `s1` 的值 "Java" 替换。

所以，最终打印的结果是：
```
我的第一语言是Python, 我的第二语言是Java
```

选项 C 完全符合输出格式，所以 C 是正确答案。