题干是问题原因头脑风暴中是—非矩阵工具的应用。

正确答案是A: 是—非矩阵工具。

专业分析：
是—非矩阵工具（Yes-No Matrix）是一种用于帮助区分和澄清问题的工具。它通过将各种想法或选项列在矩阵中，并对每个想法进行“是”或“非”的判断，来帮助团队或个人更好地理解和分析问题。这种工具特别适用于在头脑风暴过程中产生大量想法时，帮助区分哪些想法是相关的，哪些是不相关的，从而减少混乱，提高决策的效率。

名义群组技术（Nominal Group Technique）是一种结构化的头脑风暴方法，用于产生和优先排序想法，但它并不专门用于区分和澄清问题。

配对比较法（Paired Comparison Method）是一种用于比较多个选项的工具，通过成对比较的方式确定每个选项的相对重要性，但它也不专门用于澄清问题。

因此，针对区分不同想法和澄清问题，最合适的工具是是—非矩阵工具。