根据层次聚类的步骤，合并两类后，需计算新类与当前剩余各类之间的距离（如使用最短距离法、最长距离法或平均距离法等），并更新类间距离矩阵（步骤3）。此过程确保后续合并基于最新的类间距离信息。选项A错误，因合并后计算的是类间距离而非所有样本间的距离；选项C和D违背层次聚类需迭代更新距离矩阵直至所有类合并的原则。只有选项B符合教材中“计算新类与当前各类之间的距离”的关键步骤。