在整理数据时，如果需要对大于销售5000件的店铺进行标记颜色，最简便的方法是使用条件格式。因此，正确答案是：B: 条件格式。

专业分析：

1. **条件格式**：这是电子表格软件（如Excel）中的一个功能，允许用户根据单元格的值自动应用格式。对于标记大于某个值的单元格，条件格式是最直接和有效的方法。用户可以设置条件（如大于5000），并选择一种格式（如背景色），然后软件会自动应用这些格式到符合条件的单元格。

2. **数据筛选**：数据筛选用于显示符合特定条件的记录，而不是用于格式化单元格。虽然可以通过筛选来查看大于5000件的店铺，但它不会自动改变这些单元格的颜色。

3. **定位**：定位功能用于快速选择特定类型的单元格（如空白单元格、公式错误等），但不适合用于根据数值条件来格式化单元格。

4. **查找**：查找功能用于在数据中搜索特定的文本或数值，但它不会自动应用格式。它可以帮助找到符合条件的单元格，但用户需要手动更改格式。

综上所述，条件格式是实现该需求的最简便和自动化的方法。