PPT上总结的变更请求批准人的顺序，发起人是项目管理计划中指定的范围变更的审批人，但是题干描述该项目在范围管理方面存在挑战，表明让发起人审批并不合适。所以问的是要减少问题该怎么做，那么就换成由各相关方组成的CCB来审批比较全面客观合适。

在处理项目范围变更时，变更控制的有效性对于项目的成功至关重要。根据问题的描述，当前项目范围管理存在挑战，且项目变更控制计划要求项目发起人决定是否将变更纳入项目。为了更好地管理范围变更并减少相关问题，项目经理需要确保决策过程的合理性和专业性。

让我们分析每个选项：

A: 仍由发起人对变更做出最终决定
- 这种方式可能会导致决策的主观性，因为单一决策者可能未能全面考虑项目的各个方面。

B: 由变更控制委员会来对变更做出最终决定
- 变更控制委员会（Change Control Board, CCB）通常由多方利益相关者组成，具备不同的专业背景和项目视角。这种方式能够提供更全面和客观的评估，有助于减少范围管理问题。

C: 由项目经理和发起人对变更做出最终决定
- 虽然这增加了项目经理的参与，但仍然可能缺乏足够的多样性和全面性，特别是在复杂项目中。

D: 由整个项目团队对变更做出最终决定
- 虽然可以增加透明度和团队参与感，但可能导致决策过程过于冗长，且不一定具备专业性和权威性。

综上所述，选项B是最优选择。由变更控制委员会对变更做出最终决定，可以确保决策的全面性和专业性，提升项目范围管理的有效性。因此，项目经理应该建议由变更控制委员会来对变更做出最终决定。