B错在关键路径法只是个工具，不使用筷子并不会造成饿肚子。C错在EF晚于LS是很正常的情况。D错在关键活动存在负时差是一个状态，所以需要采取措施赶进度，并不能推导出整个项目就无法按计划完成的结论。

正确答案是：D: 某关键活动存有负浮动时差。

分析：

A: 没有足够的资源进行赶工。虽然资源不足可能导致项目延迟，但这并不直接说明项目无法按进度计划完成。项目经理可能会寻找其他方法来解决资源问题，因此这不是一个直接的依据。

B: 没有使用关键路径法。关键路径法是一种项目管理工具，用于识别项目中最长的路径和关键活动。虽然没有使用关键路径法可能影响项目管理的效率和准确性，但这并不能直接说明项目无法按计划完成。

C: 关键路径上的某活动最早结束时间晚于最晚开始时间。这种情况在逻辑上是矛盾的，因为一个活动的最早结束时间不可能晚于其最晚开始时间。因此，这个选项不合逻辑。

D: 某关键活动存有负浮动时差。负浮动时差意味着该活动的计划完成时间已经超过了项目的总体时间限制，这直接表明项目进度存在问题，可能无法按计划完成。因此，这是项目经理认为项目不可能按进度计划完成的一个直接依据。